Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsx2Q61412 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsx2Q61412 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vsx2Q61412 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsx2Q61412 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsx2Q61412 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms