Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pde3bQ61409 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pde3bQ61409 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde3bQ61409 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde3bQ61409 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms