Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnot7Q60809 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnot7Q60809 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cnot7Q60809 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cnot7Q60809 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnot7Q60809 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnot7Q60809 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnot7Q60809 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnot7Q60809 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms