Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mkrn3Q60764 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mkrn3Q60764 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mkrn3Q60764 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mkrn3Q60764 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms