Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Utp18Q5SSI6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Utp18Q5SSI6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Utp18Q5SSI6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Utp18Q5SSI6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms