Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zzef1Q5SSH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zzef1Q5SSH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zzef1Q5SSH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zzef1Q5SSH7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms