Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trav8d-2Q5R1B6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trav8d-2Q5R1B6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trav8d-2Q5R1B6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trav8d-2Q5R1B6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trav8d-2Q5R1B6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms