Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SynaQ5G5D5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SynaQ5G5D5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynaQ5G5D5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SynaQ5G5D5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms