Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sfmbt2Q5DTW2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfmbt2Q5DTW2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfmbt2Q5DTW2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms