Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam208bQ5DTT3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam208bQ5DTT3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam208bQ5DTT3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam208bQ5DTT3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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