Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syne3Q4FZC9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syne3Q4FZC9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne3Q4FZC9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne3Q4FZC9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms