Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrfip1Q3UZ39 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrrfip1Q3UZ39 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrfip1Q3UZ39 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms