Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
E330014E10RikQ3UL33 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E330014E10RikQ3UL33 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
E330014E10RikQ3UL33 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330014E10RikQ3UL33 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms