Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LchnQ3UHG7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LchnQ3UHG7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LchnQ3UHG7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LchnQ3UHG7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms