Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFB7

Ntrk1, High affinity nerve growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk1Q3UFB7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ntrk1Q3UFB7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ntrk1Q3UFB7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk1Q3UFB7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk1Q3UFB7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms