Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T9

Dennd1b, DENN domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd1bQ3U1T9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dennd1bQ3U1T9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dennd1bQ3U1T9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dennd1bQ3U1T9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dennd1bQ3U1T9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dennd1bQ3U1T9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dennd1bQ3U1T9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dennd1bQ3U1T9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dennd1bQ3U1T9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dennd1bQ3U1T9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dennd1bQ3U1T9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dennd1bQ3U1T9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dennd1bQ3U1T9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms