Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc174Q3U155 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc174Q3U155 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc174Q3U155 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc174Q3U155 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms