Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfyve27Q3TXX3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfyve27Q3TXX3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfyve27Q3TXX3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfyve27Q3TXX3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms