Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl9Q32KG4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rtl9Q32KG4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rtl9Q32KG4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms