Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pi4k2aQ2TBE6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pi4k2aQ2TBE6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pi4k2aQ2TBE6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pi4k2aQ2TBE6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pi4k2aQ2TBE6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pi4k2aQ2TBE6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms