Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spatc1Q148B6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spatc1Q148B6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Spatc1Q148B6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Spatc1Q148B6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Spatc1Q148B6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Spatc1Q148B6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.8 ms