Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klrb1Q0ZUP1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrb1Q0ZUP1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrb1Q0ZUP1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms