Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab42Q0PD08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab42Q0PD08 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab42Q0PD08 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms