Protein–RNA interactions for Protein: Q06219

Nr4a2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a2Q06219 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a2Q06219 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr4a2Q06219 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr4a2Q06219 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr4a2Q06219 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a2Q06219 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a2Q06219 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr4a2Q06219 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms