Protein–RNA interactions for Protein: Q06180

Ptpn2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn2Q06180 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn2Q06180 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn2Q06180 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn2Q06180 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms