Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox10Q04888 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sox10Q04888 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox10Q04888 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sox10Q04888 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox10Q04888 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms