Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax5Q02650 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pax5Q02650 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax5Q02650 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms