Protein–RNA interactions for Protein: P99024

Tubb5, Tubulin beta-5 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb5P99024 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb5P99024 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb5P99024 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubb5P99024 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubb5P99024 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 541.1 ms