Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VldlrP98156 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VldlrP98156 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VldlrP98156 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VldlrP98156 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VldlrP98156 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VldlrP98156 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VldlrP98156 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VldlrP98156 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VldlrP98156 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VldlrP98156 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VldlrP98156 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
VldlrP98156 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VldlrP98156 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms