Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas1P97459 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas1P97459 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas1P97459 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas1P97459 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Npas1P97459 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Npas1P97459 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas1P97459 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas1P97459 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms