Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mesp1P97309 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mesp1P97309 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mesp1P97309 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms