Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx1P81068 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx1P81068 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx1P81068 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx1P81068 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx1P81068 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx1P81068 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx1P81068 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx1P81068 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx1P81068 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx1P81068 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx1P81068 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms