Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmgb1P63158 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hmgb1P63158 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgb1P63158 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmgb1P63158 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms