Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arl1P61211 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl1P61211 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arl1P61211 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arl1P61211 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl1P61211 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl1P61211 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arl1P61211 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl1P61211 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl1P61211 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arl1P61211 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl1P61211 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl1P61211 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl1P61211 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl1P61211 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl1P61211 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl1P61211 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl1P61211 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms