Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpm2P58774 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm2P58774 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm2P58774 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms