Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf2P58021 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tm9sf2P58021 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tm9sf2P58021 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm9sf2P58021 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm9sf2P58021 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tm9sf2P58021 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tm9sf2P58021 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tm9sf2P58021 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tm9sf2P58021 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms