Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn5P54830 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn5P54830 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn5P54830 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms