Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc4P54775 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc4P54775 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmc4P54775 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmc4P54775 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmc4P54775 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms