Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PolgP54099 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PolgP54099 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolgP54099 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolgP54099 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolgP54099 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolgP54099 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolgP54099 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolgP54099 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolgP54099 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolgP54099 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolgP54099 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolgP54099 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolgP54099 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolgP54099 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolgP54099 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolgP54099 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolgP54099 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolgP54099 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolgP54099 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolgP54099 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolgP54099 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PolgP54099 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PolgP54099 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PolgP54099 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PolgP54099 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PolgP54099 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PolgP54099 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PolgP54099 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolgP54099 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolgP54099 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolgP54099 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolgP54099 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolgP54099 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PolgP54099 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PolgP54099 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PolgP54099 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PolgP54099 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PolgP54099 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PolgP54099 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PolgP54099 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PolgP54099 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PolgP54099 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PolgP54099 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PolgP54099 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PolgP54099 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PolgP54099 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PolgP54099 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PolgP54099 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PolgP54099 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PolgP54099 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PolgP54099 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PolgP54099 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PolgP54099 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PolgP54099 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PolgP54099 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PolgP54099 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PolgP54099 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PolgP54099 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PolgP54099 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PolgP54099 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PolgP54099 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolgP54099 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolgP54099 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolgP54099 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolgP54099 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolgP54099 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolgP54099 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolgP54099 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PolgP54099 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolgP54099 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolgP54099 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PolgP54099 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolgP54099 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolgP54099 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PolgP54099 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PolgP54099 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PolgP54099 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolgP54099 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolgP54099 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolgP54099 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PolgP54099 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PolgP54099 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PolgP54099 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PolgP54099 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PolgP54099 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolgP54099 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolgP54099 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolgP54099 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PolgP54099 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolgP54099 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolgP54099 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolgP54099 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolgP54099 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PolgP54099 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolgP54099 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolgP54099 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolgP54099 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PolgP54099 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PolgP54099 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms