Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HccsP53702 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HccsP53702 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HccsP53702 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HccsP53702 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HccsP53702 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HccsP53702 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HccsP53702 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HccsP53702 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HccsP53702 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HccsP53702 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HccsP53702 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HccsP53702 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HccsP53702 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HccsP53702 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HccsP53702 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HccsP53702 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HccsP53702 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HccsP53702 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HccsP53702 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HccsP53702 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HccsP53702 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HccsP53702 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HccsP53702 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HccsP53702 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HccsP53702 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HccsP53702 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HccsP53702 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HccsP53702 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HccsP53702 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HccsP53702 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HccsP53702 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HccsP53702 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HccsP53702 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HccsP53702 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HccsP53702 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HccsP53702 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HccsP53702 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HccsP53702 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HccsP53702 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HccsP53702 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HccsP53702 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HccsP53702 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HccsP53702 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HccsP53702 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HccsP53702 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HccsP53702 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HccsP53702 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HccsP53702 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HccsP53702 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HccsP53702 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HccsP53702 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HccsP53702 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HccsP53702 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HccsP53702 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HccsP53702 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HccsP53702 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HccsP53702 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HccsP53702 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HccsP53702 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HccsP53702 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HccsP53702 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HccsP53702 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HccsP53702 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HccsP53702 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HccsP53702 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HccsP53702 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HccsP53702 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HccsP53702 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HccsP53702 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HccsP53702 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HccsP53702 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HccsP53702 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HccsP53702 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HccsP53702 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HccsP53702 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HccsP53702 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HccsP53702 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HccsP53702 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HccsP53702 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HccsP53702 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HccsP53702 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HccsP53702 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HccsP53702 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HccsP53702 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HccsP53702 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HccsP53702 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HccsP53702 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HccsP53702 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202 ms