Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CebpaP53566 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CebpaP53566 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CebpaP53566 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CebpaP53566 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CebpaP53566 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CebpaP53566 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CebpaP53566 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CebpaP53566 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpaP53566 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CebpaP53566 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CebpaP53566 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CebpaP53566 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CebpaP53566 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CebpaP53566 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CebpaP53566 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms