Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LtbrP50284 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LtbrP50284 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LtbrP50284 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LtbrP50284 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LtbrP50284 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LtbrP50284 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LtbrP50284 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LtbrP50284 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LtbrP50284 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LtbrP50284 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LtbrP50284 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LtbrP50284 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms