Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdkn1cP49919 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkn1cP49919 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkn1cP49919 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms