Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx2P48379 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx2P48379 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx2P48379 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx2P48379 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms