Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syt1P46096 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syt1P46096 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syt1P46096 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Syt1P46096 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syt1P46096 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syt1P46096 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Syt1P46096 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Syt1P46096 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syt1P46096 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syt1P46096 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syt1P46096 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syt1P46096 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syt1P46096 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt1P46096 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt1P46096 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syt1P46096 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syt1P46096 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syt1P46096 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syt1P46096 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syt1P46096 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syt1P46096 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syt1P46096 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syt1P46096 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syt1P46096 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Syt1P46096 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syt1P46096 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syt1P46096 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syt1P46096 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syt1P46096 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syt1P46096 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syt1P46096 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms