Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoc1P34928 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc1P34928 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc1P34928 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms