Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2aP34056 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tfap2aP34056 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tfap2aP34056 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tfap2aP34056 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms