Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RxrbP28704 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RxrbP28704 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RxrbP28704 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RxrbP28704 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RxrbP28704 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrbP28704 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RxrbP28704 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrbP28704 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrbP28704 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxrbP28704 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrbP28704 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RxrbP28704 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RxrbP28704 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrbP28704 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RxrbP28704 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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