Protein–RNA interactions for Protein: P28651

Ca8, Carbonic anhydrase-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca8P28651 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca8P28651 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca8P28651 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca8P28651 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca8P28651 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca8P28651 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca8P28651 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca8P28651 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca8P28651 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca8P28651 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca8P28651 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ca8P28651 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ca8P28651 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ca8P28651 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca8P28651 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca8P28651 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms