Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb1P28230 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb1P28230 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb1P28230 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb1P28230 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms